Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf7Q9DAG9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf7Q9DAG9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf7Q9DAG9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Phf7Q9DAG9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Phf7Q9DAG9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf7Q9DAG9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf7Q9DAG9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms