Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem89Q9DA04 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem89Q9DA04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms