Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SlirpQ9D8T7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlirpQ9D8T7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SlirpQ9D8T7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms