Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Alkbh4Q9D8F1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Alkbh4Q9D8F1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms