Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm5Q9D806 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm5Q9D806 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm5Q9D806 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms