Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmigd1Q9D7L8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd1Q9D7L8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd1Q9D7L8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms