Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc3Q9D6Y1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc3Q9D6Y1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms