Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tube1Q9D6T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tube1Q9D6T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tube1Q9D6T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tube1Q9D6T1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms