Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem30cQ9D4D7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem30cQ9D4D7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms