Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx29Q9D3S3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx29Q9D3S3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx29Q9D3S3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms