Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chordc1Q9D1P4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chordc1Q9D1P4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chordc1Q9D1P4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms