Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SarnpQ9D1J3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SarnpQ9D1J3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SarnpQ9D1J3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms