Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl3Q9CZW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acsl3Q9CZW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl3Q9CZW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms