Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MtrexQ9CZU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MtrexQ9CZU3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MtrexQ9CZU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms