Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa9Q9CZN4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisa9Q9CZN4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shisa9Q9CZN4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms