Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl35Q9CZ49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl35Q9CZ49 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl35Q9CZ49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms