Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yif1bQ9CX30 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yif1bQ9CX30 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yif1bQ9CX30 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yif1bQ9CX30 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Yif1bQ9CX30 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yif1bQ9CX30 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Yif1bQ9CX30 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Yif1bQ9CX30 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms