Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dis3Q9CSH3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dis3Q9CSH3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dis3Q9CSH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dis3Q9CSH3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms