Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc96Q9CR92 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc96Q9CR92 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc96Q9CR92 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc96Q9CR92 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms