Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gkn2Q9CQS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gkn2Q9CQS6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gkn2Q9CQS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms