Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nudt21Q9CQF3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nudt21Q9CQF3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudt21Q9CQF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms