Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms