Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700029P11RikQ9CQ68 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms