Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mid1ip1Q9CQ20 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms