Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf8Q99PV0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf8Q99PV0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf8Q99PV0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms