Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rrbp1Q99PL5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rrbp1Q99PL5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rrbp1Q99PL5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rrbp1Q99PL5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rrbp1Q99PL5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms