Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2ird2Q99NI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms