Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bco2Q99NF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bco2Q99NF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bco2Q99NF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bco2Q99NF1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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