Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SrrtQ99MR6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SrrtQ99MR6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SrrtQ99MR6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms