Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk5rap3Q99LM2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5rap3Q99LM2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms