Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lysmd3Q99LE3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lysmd3Q99LE3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lysmd3Q99LE3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms