Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sntg1Q925E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sntg1Q925E1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sntg1Q925E1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms