Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spdl1Q923A2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spdl1Q923A2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spdl1Q923A2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms