Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek8Q91ZR4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek8Q91ZR4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek8Q91ZR4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms