Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atpaf2Q91YY4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atpaf2Q91YY4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atpaf2Q91YY4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms