Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha12Q91Y18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha12Q91Y18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdha12Q91Y18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms