Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHZ7

Imp4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Imp4Q8VHZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Imp4Q8VHZ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Imp4Q8VHZ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Imp4Q8VHZ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms