Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rpap2Q8VC34 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpap2Q8VC34 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpap2Q8VC34 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms