Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BbxQ8VBW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BbxQ8VBW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BbxQ8VBW5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms