Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Hecw1Q8K4P8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Hecw1Q8K4P8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Hecw1Q8K4P8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms