Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4K6

Pank1, Pantothenate kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank1Q8K4K6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pank1Q8K4K6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pank1Q8K4K6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pank1Q8K4K6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pank1Q8K4K6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pank1Q8K4K6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.9 ms