Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrtm1Q8K377 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrtm1Q8K377 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms