Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2q2Q8K2Z8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ube2q2Q8K2Z8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q2Q8K2Z8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q2Q8K2Z8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms