Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a8Q8JZR6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a8Q8JZR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms