Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prmt5Q8CIG8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prmt5Q8CIG8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prmt5Q8CIG8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms