Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG65

Sspo, SCO-spondin, mousemouse

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Length 4,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspoQ8CG65 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SspoQ8CG65 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SspoQ8CG65 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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