Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacnb2Q8CC27 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb2Q8CC27 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms