Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phtf2Q8CB19 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phtf2Q8CB19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Phtf2Q8CB19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms