Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc15Q8C9M2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc15Q8C9M2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc15Q8C9M2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc15Q8C9M2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms