Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppfibp1Q8C8U0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ppfibp1Q8C8U0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppfibp1Q8C8U0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms